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大分県の高校からドラフト会議で指名された選手を記載しています。ドラフト外はこちら| 津久見 （2012年に津久見・臼杵商・海洋科学の3校が統合） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 池田 重喜 | 津久見高→日鉱佐賀関→1965広島15位 津久見高→日鉱佐賀関→1967大洋4位 |
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| 中村 国昭 | 津久見高→日鉱佐賀関→1966（1次）巨人5位 | |
| 岩崎 忠義 | 津久見高→1966（2次）東京2位 | 1965 1966 |
| 吉良 修一 | 津久見高→1967阪神2位 | |
| 高橋 直樹 | 津久見高→早稲田大→日本鋼管→1967東映3位 | |
| 山口 久仁男 | 津久見高→1967サンケイ7位 | 1966 |
| 大田 卓司 | 津久見高→1968西鉄9位 | 1968 |
| 石井 吉左衛門 | 津久見高→1968西鉄10位 津久見高→鐘淵化学→1970ロッテ8位 |
1968 |
| 浜浦 徹 | 津久見高→1970ロッテ2位 | |
| 橘 健治 | 津久見高→1971近鉄3位 | |
| 水江 正臣 | 津久見高→1972ヤクルト6位 | 1972 |
| 中川 信秀 | 津久見高→1972太平洋7位 | 1972 |
| 浜名 繁幸 | 臼杵商高→1974南海3位 | |
| 岩井 靖久 | 津久見高→法政大→1975大洋2位 | |
| 谷崎 浩二 | 津久見高→九州産交→1978近鉄4位 | |
| 小原 正行 | 臼杵商高→1980巨人3位 | |
| 日野 善朗 | 津久見高→新日鉄大分→1984大洋2位 | |
| 川崎 憲次郎 | 津久見高→1988ヤクルト1位 | 1988 |
| 佐藤 裕幸 | 津久見高→1988広島2位 | 1988 |
| 土谷 鉄平 | 津久見高→2000中日5位 | |
| 岩尾 利弘 | 津久見高→別府大→2009西武3位 | |
| 明 豊 （別府大付と明星が統合） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 衛藤 雅登 | 別府大付高→1965西鉄11位 | |
| 宮本 実 | 別府大付高→河合楽器→1971近鉄9位 | |
| 島津 佳一 | 別府大付高→大東文化大→本田技研鈴鹿→1973日本ハム2位 | |
| ウイリー木原 | 別府大付高→1973大洋4位 | |
| 井上 晃二 | 別府大付高→1978日本ハム3位 | |
| 石本 努 | 別府大付高→1990日本ハム2位 | |
| 仲光 秀記 | 別府大付高→1991日本ハム5位 | |
| 城島 健司 | 別府大付高→1994ダイエー1位 | |
| 田中 敬人 | 別府大付高→駒沢大→NKK→JFE西日本→2004広島8巡目 | |
| 今宮 健太 | 明豊高→2009ソフトバンク1位 | 2009 |
| 山野 恭介 | 明豊高→2010（育成）広島1位 | 2009 |
| 浜田 太貴 | 明豊高→2018ヤクルト4位 | 2017 |
| 居谷 匠真 | 明豊高→2020（育成）ソフトバンク6位 | |
| 京本 真 | 明豊高→2021（育成）巨人7位 | 2021 |
| 大分商 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 河原 明 | 大分商高→1967西鉄1位 | 1967 |
| 島崎 基慈 | 大分商高→1968阪急6位 | 1967 |
| 小川 清一 | 大分商高→1970阪神6位 | 1970 |
| 足立 義男 | 大分商高→大分鉄道管理局→1975阪神1位 | |
| 岡崎 郁 | 大分商高→1979巨人3位 | 1979 |
| 小野 淳平 | 大分商高→日本文理大→2009巨人5位 | |
| 笠谷 俊介 | 大分商高→2014ソフトバンク4位 | 2013 |
| 川瀬 晃 | 大分商高→2015ソフトバンク6位 | |
| 源田 壮亮 | 大分商高→愛知学院大→トヨタ自動車→2016西武3位 | |
| 広沢 伸哉 | 大分商高→2017オリックス7位 | |
| 森下 暢仁 | 大分商高→明治大→2019広島1位 | |
| 川瀬 堅斗 | 大分商高→2020（育成）オリックス1位 | |
| 三代 祥貴 | 大分商高→2021（育成）ソフトバンク12位 | |
| 中津東 （中津工と中津商が統合） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 山口 喜司 | 中津東高→大分鉄道管理局→陸上自衛隊→1968広島3位 | |
| 小野 泰敏 | 中津工高→1966（1次）西鉄6位 | |
| 松尾 幸一 | 中津工高→1967サンケイ12位 | |
| 大島 康徳 | 中津工高→1968中日3位 | |
| 春日 一平 | 中津工高→1968西鉄5位 | |
| 尾西 和夫 | 中津工高→新日鉄堺→1973巨人5位 中津工高→新日鉄堺→1975近鉄2位 |
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| 長松 純明 | 中津工高→福岡工大→1974ロッテ2位 | |
| 春日 祥之輔 | 中津工高→鐘淵化学→1974太平洋5位 | |
| 渡辺 光弘 | 中津工高→1975南海2位 | |
| 奥村 政稔 | 中津商高→九州国際大（中退）→三菱重工長崎→三菱日立パワーシステムズ→2018ソフトバンク7位 | |
| 柳ヶ浦 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 山下 和彦 | 柳ヶ浦高→新日鉄大分→1984近鉄4位 | |
| 山本 大貴 | 柳ヶ浦高→阿部企業→1991オリックス7位 | |
| 岡本 克道 | 柳ヶ浦高→東芝→1996ダイエー5位 | 1991 |
| 吉良 俊則 | 柳ヶ浦高→2003近鉄2巡目 | 2002 2003 |
| 山口 俊 | 柳ヶ浦高→2005横浜1巡目 | 2003 |
| 脇谷 亮太 | 柳ヶ浦高→日本文理大→ＮＴＴ西日本→2005（大・社）巨人5巡目 | |
| 藤沢 拓斗 | 柳ヶ浦高→西濃運輸→2013中日6位 | |
| 田中 瑛斗 | 柳ヶ浦高→2017日本ハム3位 | |
| 上間 永遠 | 柳ヶ浦高→徳島インディゴソックス→2019西武7位 | |
| 別府鶴見丘 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 浜口 政信 | 別府鶴見丘高→1965年サンケイ4位 | |
| 大場 隆広 | 別府鶴見丘高→1966（1次）中日1位 | |
| 三好 行夫 | 別府鶴見丘高→1966（1次）南海8位 別府鶴見丘高→日鉱佐賀関→1968阪急10位 |
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| 大下 正忠 | 別府鶴見丘高→1968巨人7位 | |
| 貞山 健源 | 別府鶴見丘高→1972太平洋8位 | |
| 長野 隆裕 | 別府鶴見丘高→1973大洋6位 | |
| 日田林工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 高瀬 逸夫 | 日田林工高→1967南海16位 | |
| 渡辺 麿史 | 日田林工高→日鉱佐賀関→1976近鉄4位 | |
| 源五郎丸 洋 | 日田林工高→1981阪神1位 | |
| 村岡 耕一 | 日田林工高→電電九州→1981大洋3位 | |
| 樋口 龍美 | 日田林工高→九州国際大→ＪＲ九州→2004中日自由枠 | |
| 佐伯豊南 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 広瀬 宰 | 佐伯豊南高→東京農大→1968ロッテ2位 | |
| 塩月 勝義 | 佐伯豊南高→1970西鉄8位 佐伯豊南高→協和醗酵→1974巨人4位 |
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| 菅 豊 | 佐伯豊南高→1970西鉄9位 | |
| 青野 信二 | 佐伯豊南高→1988西武4位 | |
| 高 田 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 成重 春生 | 高田高→大昭和製紙→大昭和製紙北海道→1971ロッテ8位 | |
| 太田 龍生 | 高田高→1982広島4位 | |
| 金田 政彦 | 高田高→日産自動車九州→1992オリックス2位 | |
| 田崎 昌弘 | 高田高→九州工大→JR九州→2001横浜5巡目 | |
| 国 東 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 吉田 豊彦 | 国東高→本田技研熊本→1987南海1位 | |
| 弓長 起浩 | 国東高→亜細亜大→熊谷組→1991阪神3位 | |
| 吉武 真太郎 | 国東高→1993ダイエー4位 | |
| 萱島 大介 | 国東高→福岡大→ローソン→2002阪神11巡目 | |
| 大 分 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 岩崎 久則 | 大分高→新日鉄大分→1990オリックス4位 | |
| 佐野 皓大 | 大分高→2014オリックス3位 | 2014 |
| 江川 侑斗 | 大分高→2019（育成）楽天1位 | |
| 川上 理偉 | 大分高→宮崎福祉医療カレッジ→大分B-リングス→2023（育成）中日4位 | |
| 藤 蔭 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 川崎 義文 | 藤蔭高→日本通運→1993横浜4位 | |
| 森 章剛 | 藤蔭高→1997中日2位 | |
| 一岡 竜司 | 藤蔭高→沖データコンピュータ教育学院→2011巨人3位 | |
| 松石 信八 | 藤蔭高→2023（育成）ロッテ2位 | |
| 別府翔青 （別府商・別府青山・別府羽室台の3校が統合） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 荒金 雄司 | 別府商高→1970広島6位 | |
| 大塚 明 | 別府羽室台高→1993ロッテ3位 | |
| 大山 暁史 | 別府青山高→亜細亜大→セガサミー →2013オリックス8位 | 2005 |
| 鶴崎工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 藤沢 哲也 | 鶴崎工高→1971中日1位 | 1971 |
| 田崎 正明 | 鶴崎工高→電電近畿→1984近鉄6位 | |
| 小石 博孝 | 鶴崎工高→立正大→NTT東日本→2011西武2位 | |
| 佐伯鶴城 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 野村 謙二郎 | 佐伯鶴城高→駒沢大→1988広島1位 | |
| 広瀬 純 | 佐伯鶴城高→法政大→2000広島2位 | 1996 |
| 古川 雄大 | 佐伯鶴城高→2022西武2位 | |
| 大分工 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 内川 聖一 | 大分工高→2000横浜1位 | |
| 竹下 慎太郎 | 大分工高→三菱自動車川崎→大分硬式野球倶楽部→2000横浜8位 | |
| 田中 太一 | 大分工高→2010巨人3位 | 2010 |
| 楊志館 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 川口 容資 | 楊志館高→2005（高校）ソフトバンク5巡目 | |
| 甲斐 拓也 | 揚志館高→2010（育成）ソフトバンク6位 | |
| 松冨 倫 | 楊志館高→別府大→2012（育成）巨人2位 | 2007 |
| 臼 杵 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 川野 雄一 | 臼杵高→1968西鉄8位 | |
| 鳥越 裕介 | 臼杵高→明治大→1993中日2位 | |
| 大分雄城台 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 安藤 優也 | 大分雄城台高→法政大→トヨタ自動車→2001阪神自由枠 | |
| 梶原 昂希 | 大分雄城台高→神奈川大→2021DeNA6位 | |
| 芸術緑丘 （旧校名：別府緑丘〜芸術短大付緑丘） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 松下 芳夫 | 別府緑丘高→電電近畿→1967近鉄5位 | |
| 大 野 （廃校） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 芦刈 芳久 | 大野高→1988オリックス6位 | |
| 日本文理大付 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 日高 亮 | 日本文理大付高→2008ヤクルト4位 | |
| 日出総合 （日出暘谷と山香農業が統合） | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 永野 将司 | 日出暘谷高→九州国際大→ホンダ→2017ロッテ6位 | |
| 大分舞鶴 | ||
| 選手名 | 指名年度とプロ入り後の成績 | 夏の甲子園 |
| 常広 羽也斗 | 大分舞鶴高→青山学院大→2023広島1位 | |
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