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| ヤクルト | DeNA | 中日 | 巨人 | 全指名選手 | ||
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2016年（平成28年）育成ドラフトの結果
2016年育成ドラフトは8球団により行われた。
| 読売ジャイアンツ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 高井 俊 | BC・新潟 | 投手 | 支300万、年240万 |
| 2位 | 加藤 脩平 | 磐田東高 | 外野手 | 支200万、年240万 |
| 3位 | 山川 和大 | BFL・兵庫 | 投手 | 支300万、年240万 |
| 4位 | 坂本 工宜 | 関西学院大 | 投手 | 支300万、年240万 |
| 5位 | 松原 聖弥 | 明星大 | 外野手 | 支300万、年240万 |
| 6位 | 高山 竜太朗 | 九州産業大 | 捕手 | 支300万、年240万 |
| 7位 | 堀岡 隼人 | 青森山田高 | 投手 | 支200万、年240万 |
| 8位 | 松沢 裕介 | 四国IL・香川 | 外野手 | 支300万、年240万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 横浜DeNAベイスターズ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 笠井 崇正 | BC・信濃 | 投手 | 支300万、年360万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 東京ヤクルトスワローズ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 大村 孟 | BC・石川 | 捕手 | 支300万、年280万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 中日ドラゴンズ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 木下 雄介 | 四国IL・徳島 | 投手 | 支200万、年300万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 福岡ソフトバンクホークス | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 大本 将吾 | 帝京第五高 | 外野手 | 支300万、年300万 |
| 2位 | 長谷川 宙輝 | 聖徳学園高 | 投手 | 支300万、年300万 |
| 3位 | 田城 飛翔 | 八戸学院光星高 | 外野手 | 支300万、年300万 |
| 4位 | 森山 孔介 | 藤沢翔陵高 | 内野手 | 支300万、年300万 |
| 5位 | 清水 陸哉 | 京都国際高 | 外野手 | 支300万、年300万 |
| 6位 | 松本 龍憲 | 崇徳高 | 内野手 | 支300万、年300万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 千葉ロッテマリーンズ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 安江 嘉純 | BC・石川 | 投手 | 支300万、年240万 |
| 2位 | 菅原 祥太 | 日本ウェルネス大 | 外野手 | 支300万、年240万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| 東北楽天ゴールデンイーグルス | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 千葉 耕太 | 花巻東高 | 投手 | 支200万、年250万 |
| 2位 | 南 要輔 | 明星大 | 内野手 | 支200万、年250万 |
| 3位 | 向谷 拓巳 | BFL・兵庫 | 内野手 | 支200万、年250万 |
| 4位 | 木村 敏靖 | 履正社専門学校 | 投手 | 支200万、年250万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
| オリックス・バファローズ | ||||
| 順位 | 選手名 | 所属 | 位置 | 支度金と年俸 |
| 1位 | 張 奕 | 日本経済大 | 外野手 | 支300万、年250万 |
| 2位 | 榊原 翼 | 浦和学院高 | 投手 | 支300万、年250万 |
| 3位 | 神戸 文也 | 立正大 | 投手 | 支300万、年250万 |
| 4位 | 坂本 一将 | BC・石川 | 内野手 | 支300万、年250万 |
| 5位 | 中道 勝士 | 明治大 | 捕手 | 支300万、年250万 |
| ★プロ入り後の成績★ | ||||
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